शंकराचार्य स्वरूपा नंद महाराज ने अयोध्या मंदिर मस्जिद मामले में सुप्रीम कोर्ट के फैसले पर सवाल उठाए हैं। शंकराचार्य स्वरूपानंद सरस्वती ने कहा कि राम जन्मभूमि को पूर्ण रूप से मस्जिद मानते हुए कहा जाना की मूर्ति मस्जिद में रखी गई और मस्जिद को नापाक किया गया सर्वथा गलत है। हमारी संस्था राम जन्मभूमि पुनरुद्धार समिति ने कोर्ट में सिद्ध किया है कि अयोध्या में राम जन्मभूमि है जिसे हमारे शास्त्र प्रमाणित करते हैं।